明神宗晚年又出现了国本之争，先前一宫女为神宗生下了长子朱常洛，后来神宗的宠妃郑贵妃又为其生下了朱常洵。神宗在郑贵妃的鼓动下，总想借机立朱常洵为太子，却遭到了朝中众臣（主如果东林党人）的逝世力否决，当时太子又叫国本，是以，皇帝与大年夜臣间的此次斗争又称为国本之争。国本之争是继嘉靖朝“大年夜议礼之争”后的又一次大年夜范围的皇帝与大年夜臣的冲突，不过此次的成功者是众大年夜臣，最终朱常洛当上了太子，而郑贵妃的儿子朱常洵被封为福王（后被李自成农平易近军所杀）。使东林党人和福王系之间有了间隙，为日后留下了一丝祸患。（详见南明弘光帝）明神宗走完了他抵触的平生，在他的继位的前十年发奋图强，在张居正的辅佐下，使明王朝的经济获得了空前的繁华，在江南地区已经出现了本钱主义萌芽；中心十年由勤变懒，最后近三十年万事不睬。但却始终魁柄独持，从这一点说，他毫不是一个庸人之辈。但他又缺乏明太祖、明成祖那样的雄才大年夜略。加上他沉沦酒色、财贿的心理，非但未能使明朝中兴。相反却把明朝推向绝境。是以后人评论“明之亡，实亡于神宗。　　万历皇帝朱翊钧（1563年