案件始末
　　同治九年七月二十六日（1870年8月22日）早上10:30阁下，两江总督马新贻自检阅校对场不雅清军射箭练习，阅兵后，返回总督辕门，半途有人拦路喊冤，刺客张汶祥趁隙以匕首刺杀，延至隔日不治身亡[1]。张汶祥刺杀成功之后束手就擒，在狱中泄漏，下手谋杀的主因是马“不仁不义”，但实情则矢口不说，指名曾国藩和刑部尚书郑敦谨来审理，才愿供出实情。
　　案发前，江苏巡抚丁日昌子丁慧衡于秦淮河畔为了争夺妓女，与马幕府之官争风吃醋起冲突，马命令逮捕慧衡。丁日昌与丁慧衡出于湘军体系[2]，也有一说为马就任是奉慈禧太后令，刺探湘军曾掠夺若干宁靖军财宝，因而被湘军人士密谋。
　　魁玉审理刺马案月余，毫无进展，九月一日，张之洞从兄张之万赴金陵，与魁玉会审，马新贻部属袁保庆等人请求酷刑问讯，张之万以“案情重大年夜，不便徒事刑求。偿未正典刑而瘐逝世，谁负其咎”拒之，最后仍无成果，张之万同魁玉上奏说：“凶犯张汶祥曾从发、捻，复通海盗，因马新贻前在浙抚任内，剿办南田海盗，戮伊伙党甚多。又因伊妻罗氏为吴炳燮诱逃，曾于马新贻阅边至宁波时，拦舆呈控，未准审理，该犯心怀忿恨。适在逃海盗龙启云等复指使，张汶祥为同伙报仇，即为本身泄恨，张汶祥被激许可。……本年七月二十六日，侍从混进督署，凸起行凶，再三质讯，矢口不移其供，无另有主使各情，尚属可托。”
　　未及一年，曾国藩病逝于两江总督府辕门内，遂为悬案。马新贻被刺一案后来成为不少戏曲、片子和电视剧中“刺马”的题材。
　　平易近间传说
　　慈禧太后起火，再派刑部尚书郑敦谨与曾国藩亲至两江总督辕门查案，太后曾问曾国藩：“此案岂不甚怪？”曾国藩答：“切实其实怪。”太后促曾国藩接任总督，并速至金陵查案，曾氏却告以病延迟数月未行；太后第二次问起，曾氏才履新。抵达江宁府后，曾国藩不审案，却每日翻看纪晓岚写作的志怪小说《阅微草堂笔记》，安闲度日。直到郑敦谨抵江宁后，曾才开端调阅檀卷。邓之诚《古董三记》说：“国藩不欲深求，必有不克不及深求者在。”郑敦谨连审14日，仍查不出实情，只好和曾国藩联名上奏：“此案张之万等审判成果，是实！”同治十年（1871年）三月二十六日，朝廷下旨，将刺客张汶祥凌迟处逝世。郑敦谨感慨宦海阴郁，索性去官归乡。
　　传说马新贻在伐罪宁靖军时身陷围阵中，为了诈和，与宁靖军首级张汶祥义结金兰，发誓以大年夜清当局官员的身份，为宁靖军做清当局卧底，于是始得历劫归去。后来马新贻背信弃约，反而以行走宁靖虎帐之便，做宁靖军卧底，诱剿宁靖军，终至张汶祥这支军团敏捷覆亡，张汶祥认为马新贻背信忘义，便起刺杀马新贻之举。
　　另一说是宁靖天堂灭亡后，江南为曾国藩的湘军体系把持，而国度经比年战乱，府库耗竭。清廷派任马新贻接两江总督，而不派功大年夜的曾国藩，一方面是就是顾忌湘军，恐湘军坐大年夜。另一个原因是，霸占金陵后，宁靖天堂库藏的大年夜量银两都没有上缴朝廷。湘军方面的说法，是已经都被宁靖军烧毁，付之一炬。慈禧太后困惑都入了曾国藩等将领的口袋，十分不满，却又不敢与湘军为此决裂。是以清廷才派任马新贻，暗查此事。
　　湘军人马怕私吞战利品一事被揭穿出来，遂结合宁靖天堂旧权势，刺杀马新贻，更藉以制造事端，强迫清廷派任曾国藩为两江总督。慈禧太后看朝廷派去的马新贻孤掌难鸣，无头无尾的逝世去，知道无力管辖江南，于是只好屈从湘军，改派曾国藩接任两江总督。而曾国藩老谋深算，怕清廷怀疑，又害怕舆论，还第一次有意拒绝。他到了金陵，也懂得私吞战利品一案，连累广泛，又都是他的旧部，案子也办不下去。
　　是以，自宁靖天堂后，东南已非清廷权势所及，实为湘军体系把持。后来庚子拳乱，东南自保活动，良有以也。