商船三井公司（Mitsui O.S.K. Lines, Ltd 简称：MOL）是日本的大型海运公司，在东京证券交易所(TYO: 9104 )上市。总部位于日本东京都港区。因为公司最早的源流为大阪商船，所以登记上的本部地址为大阪市北区中之岛。
商船三井与日本邮船及川崎汽船并称为日本三大海运公司，以纯利润及市价总值计算居日本第一位，而销售额则仅次于日本邮船。商船三井是三井集团的三井船舶与住友集团的大坂商船合并而成的，合并后公司名称为“大坂商船三井船舶”，在1999年，与三和银行（今 三菱东京UFJ银行）旗下的公司合并，并改为现今的公司名称。商船三井的货柜是以鳄鱼扛货柜为标志，是个明显又有趣的特征。
不同于马士基等以集装箱运输为主的海运公司，商船三井的经营范围涉及到各个船种。截止到2008年3月底，共计拥有各类商船845只，5,434万重量吨，是世界最大的船队。同时商船三井拥有业界第一位的LNG船队，以及强大的干散货船和汽车滚装船，而集装箱运输领域则居世界10名左右。在2008年财富世界500强排名中，商船三井与马士基，日本邮船及中远集团作为仅有的四家国际航运企业入选。
商船三井在中国有一百三十年的宝贵经验。追溯至1878年，蒸汽船 “秀吉丸” 从日本九州的三池运送煤炭到中国来。今天，中国已成为一个煤炭主要出口国，但商船三井仍肩负着运输责任，参与其中。自十九世纪以来，商船三井(原大阪三井)积极地参与经营中国与日本之间的客运及货运业务，范围遍及大连，天津(塘沽)，上海，汉口(武汉)，福州，厦门，广州等地区。商船三井(中国)有限公司成立于1995年，总部设于上海，为商船三井的全资附属子公司，目前有27个分公司/代表处，及约有三百名员工，并分布在沿海各重要口岸及城市。随着中国进出口市场不断地蓬勃发展，商船三井(中国)公司的业务量亦同步共进。
